La fin de l’été et le début de l’automne constituent une période privilégiée pour intervenir dans les cours d’eau. Les niveaux d’eau sont généralement plus faibles, ce qui facilite la réalisation des travaux tout en limitant les impacts sur les milieux aquatiques et les risques liés aux crues. Plusieurs opérations de restauration sont actuellement engagées sur le département afin d’améliorer le fonctionnement écologique des rivières et des zones humides riveraines
Le Pontot retrouve son tracé naturel
La Fédération du Doubs pour la Pêche et la Protection du Milieu Aquatique conduit actuellement un important projet de restauration du ruisseau du Pontot, entre Pouilley-Français et Dannemarie-sur-Crète. Ce petit affluent du Doubs a subi de nombreuses modifications au cours des siècles et son fonctionnement écologique s’est fortement dégradé.
Les travaux visent notamment à redonner au cours d’eau un tracé plus naturel par reméandrement, à restaurer les habitats aquatiques et à favoriser le retour de la biodiversité. La remise du ruisseau dans son fond de vallée originel et la création d’un lit guide de petit gabarit permettront de rehausser la ligne d’eau du ruisseau et par conséquent de remonter le niveau de la nappe d’accompagnement dans les terres riveraines. Un objectif de stockage d’eau dans les sols et de gain de ressource en eau est donc poursuivi. À terme, soit après les deux tranches de travaux programmées en 2026 et 2027, c’est l’ensemble de la vallée du Pontot qui devrait retrouver un fonctionnement plus proche de son état naturel, et surtout une moindre vulnérabilité aux sécheresses.



Maître d’ouvrage : Fédération du Doubs pour la Pêche et la Protection du Milieu Aquatique.
Financeurs : Agence de l’eau Rhône Méditerranée Corse, Département du Doubs, Grand-Besançon Métropole
Effacement du barrage du Moulin du Plain sur le Doubs franco-suisse
À Indevillers, l’EPAGE Doubs Dessoubre engage une opération majeure de restauration de la continuité écologique du Doubs Franco-Suisse au niveau du seuil du Moulin du Plain.
Construit pour d’anciens usages aujourd’hui disparus, cet ouvrage constituait un obstacle à la circulation des poissons et au transport naturel des sédiments. Le projet prévoit le démantèlement partiel du barrage afin de conserver des vestiges témoins de l’histoire du site, le comblement d’un ancien canal ainsi que la restauration morphologique du lit de la rivière sur près d’un kilomètre.
Les travaux permettront de restaurer la continuité piscicole et sédimentaire, de diversifier les habitats aquatiques et de limiter les phénomènes de réchauffement de l’eau observés dans la retenue créée par le barrage. Le projet comprend également la restauration de la végétation des berges afin de renforcer la biodiversité du secteur.



Maître d’ouvrage : EPAGE Doubs Dessoubre.
Financeurs : Open Rivers Programme, Agence de l’eau Rhône Méditerranée Corse, collectivités membres de l’EPAGE dont le Département.
Poursuite de la restauration des cours d’eau et tourbières du bassin du Drugeon
Sur le plateau de Frasne et de Bouverans, l’EPAGE Haut-Doubs Haute-Loue mène plusieurs opérations de restauration visant à améliorer le fonctionnement hydraulique des zones humides et tourbières associées aux ruisseaux du Champ des Auges et des Melliers.
Pour le ruisseau du Champ des Auges, les travaux consistent notamment à neutraliser certains fossés de drainage, reméandrer localement le cours d’eau et restaurer sa capacité à retenir l’eau dans les tourbières. L’objectif est de rétablir le fonctionnement naturel de ces milieux humides, essentiels pour la biodiversité, le stockage du carbone et la régulation de la ressource en eau.
Le projet concernant le ruisseau des Melliers poursuit des objectifs similaires : restaurer les écoulements naturels, améliorer la qualité des habitats aquatiques et renforcer les fonctionnalités écologiques du site, notamment le stockage d’eau et de carbone dans les sols.


Maître d’ouvrage : EPAGE Haut-Doubs Haute-Loue.
Financeurs : programme européen LIFE Climat Tourbières, Agence de l’eau Rhône Méditerranée Corse, collectivités membres de l’EPAGE dont le Département.
Qu’il s’agisse de restaurer des zones humides, de redonner de l’espace aux cours d’eau ou de supprimer d’anciens obstacles, ces projets participent à un même objectif : améliorer la qualité des milieux aquatiques, renforcer leur résilience face au changement climatique et préserver durablement la ressource en eau dans le département du Doubs.
